南昌汉族人群DYS19、DYS390基因座遗传多态性研究

南昌汉族人群DYS19、DYS390基因座遗传多态性研究

龚志强, 孙小妹, 刘炯, 许小明, 冯琼[1]2004年在《南昌汉族人群DYS19、DYS390基因座遗传多态性》文中研究指明Y染色体呈父系遗传,所有基因座之间存在连锁关系,而且Y-STR基因座在不同人群的差异远远高于常染色体基因座。故Y-STR基因座分析在单亲父子对或可疑父亲缺席的父权鉴定及混合检材(精液与阴道液)的检验中以及人类遗传学研究中的特殊价值日益受到人们的重视。DY

孙小妹[2]2004年在《南昌汉族人群DYS19、DYS390基因座遗传多态性研究》文中进行了进一步梳理目的:研究中国南昌汉族人群DYS19、DYS390基因座遗传多态性。方法:应用聚合酶链反应(PCR)、聚丙烯酰胺凝胶电泳分离扩增产物结合银染显带的方法,对120例南昌汉族无关男性个体的DYS19、DYS390基因座进行检测。结果:在南昌汉族人群中DYS19、DYS390基因座分别检出6种等位基因,等位基因频率分布范围分别为0.008-0.45、0.008-0.392,基因多态性分别为0.696、0.703。上述两个Y染色体STR基因座组成的单倍型在120例无关男性个体中共观察到22种,单倍型的个人识别率为0.903。Χ2检验显示等位基因分布具有明显的人群差异。结论:DYS19、DYS390基因座是个人识别率较高的遗传标记,等位基因分布具有明显群体特异性,在法医鉴定及人类遗传学研究中具有重要的应用价值。

马骏, 朱爱华, 石津玮, 金明, 巴华杰[3]2017年在《江苏地区汉族人群23个Y染色体STR基因座的多态性》文中研究指明目的调查23个Y染色体STR基因座在江苏汉族人群中的多态性分布。方法采用Power Plex Y23荧光标记复合扩增系统,对江苏地区4821名汉族无关男性个体的静脉血DNA进行复合扩增,3500x L遗传分析仪进行毛细管电泳检测,分别计算各个STR基因座的等位基因频率和基因多样性,以及23个基因座联合构成的单倍型频率和单倍型多样性。结果 23个Y染色体STR基因座在4821名江苏汉族男性个体中的基因多样性值介于0.4099~0.9696。共检出4781种不同的单倍型,其中有4743种只出现1次,单倍型多样性达到0.99999812。结论 23个Y染色体STR基因座联合应用于江苏地区汉族人群时具有较好的遗传多态性分布,适用于该地区的群体遗传学与法医学个体识别等研究。

梁祚仁[4]2009年在《广西10个少数民族Y染色体17个STR基因座的遗传多态性》文中认为人类Y染色体属于性染色体,为正常男性所特有,除拟常染区外,在遗传过程中不发生重组,其序列结构除突变外由父代不变的传递给子代。由于此特性,通过对Y染色体第二代遗传标记――短串联重复序列(STR,short tandem repeats)的研究,可以对不同男性个体之间的种族,民族鉴定有重要的参考作用;还可根据其STR分型进行家系识别,父权鉴定;在常染色体STR比较难发挥作用的领域,如男女混合斑中男性成份的鉴定等方面能快速,有效的检出其中男性成份。基于Y-STR分析技术有此特性的前提下,为了解我国广西壮族自治区少数民族男性Y染色体STR基因座的遗传多态信息,本研究对广西的10个少数民族共1149无关男性的17个Y-STR基因座的等位基因频率分布、基因多态性、单倍型多态性进行了统计,并与其它包括广东汉族、福建汉族、南克罗地亚人、奥大利亚人的各基因座基因频率分布之间的差异作对比,观察不同人群在这些STR基因座上的差别。对10个民族作基于单倍型的分子方差分析(AMOVA),以研究10个民族间的遗传变异关系,并进一步应用DA遗传距离、N-J系统发生树、多维尺度分析(MDS)等分析方法在17个Y-STR基因座基因频率分布的基础上与上述的4个其它人群之间的进化关系作比较研究。通过这些让我们充分认识了Y-STR复合扩增技术在法医学和遗传学上的重要价值。本研究在广西壮族自治区各民族聚集地对相应民族的无关男性采集口腔拭子,其中侗族101例,苗族101例,壮族107例,瑶族105例、水族150例、仡佬族130例、仫佬族146例、京族100例、彝族101例、毛南族108例,共计1149例。利用DNA自动提取仪通过磁珠法对口腔拭子提取DNA,然后选用包括ISFH认定的最小单倍型(MHL)的9个基因座和SWGDAM推荐的基因座以及另外几个多态性较高基因座(DYS437, DYS448,DYS456, DYS458, DYS635 (Y GATA C4), and Y_GATA_H4)在内,共计17个Y-STR基因座的美国ABI公司的AmpFISTR? filerTM复合扩增试剂盒进行PCR扩增,扩增产物在3100XL型遗传分析仪进行毛细管电泳,用软件Foundation data collection收集原始扫描数据,GeneMapper ID进行Y-STR基因分型。得到Y-STR基因分型数据后,用直接计数法计算各等位基因频率。基因多样性(gene diversity,GD)及单倍型多样性(haplotype diversity,HD),按公式h=n(1-∑Pi~2)/(n-1)计算,n为样本例数,Pi为等位基因频率。并计算累积的GD值(TGD,相当于常染色体STR评估指标中的累积非父排除率CPE)按公式TGD=1-(1-GD_1)(1-GD_2)(1-GD_3)(1-GD_4)…(1-GD_n)计算,GD_n为各基因座的GD值。用arlequin 3.11软件对10个少数民族基于单倍型进行分子方差分析(AMOVA),比较10个少数民族与其它包括广东汉族、福建汉族,南克罗地亚人,澳大利亚人4个人群在内的共计14个人群的17个Y-STR基因座等位基因频率分布的差异性。用DISPAN软件根据14个人群的17个Y-STR基因座等位基因频率计算Nei提出的DA遗传距离,再利用MEGA4软件根据DA遗传距离矩阵绘制N-J进化树以及利用SPSS12.0软件的多维尺度分析(MDS)对14个人群的遗传进化关系进行分析。通过上述处理,本研究获得10个少数民族1149名男性17个Y-STR基因座的等位基因频率分布资料,在10个民族的17个基因座中共检测出个98等位基因(不包括DYS385a/b)和66个DYS385a/b单体型。频率从最低的0.0066(DYS385a/b)-最高的0.9307(彝族DYS438*10)。10个民族1149个样本观察到1129种单倍型,各民族间只观察到苗族和仡佬族有1种共享单倍型。侗族、京族、毛南族有1种单倍型出现2次,壮族、苗族,仡佬族有2种单倍型出现2次,水族和仫佬族有3种单倍型出现2次,彝族有4种单倍型出现2次。10个民族17个Y-STR基因座的GD值在0.1327-0.9663之间,单倍型多样性(HD)在0.99920-0.99983之间,累积GD值均接近1。10个少数民族的AMOVA分析表明各民族间的遗传变异较大,达到7.23%。遗传距离、N-J系统发生树以及MDS分析表明白种人和黄种人之间有明显差别,10个少数民族与汉族间有明显差别,10个少数民族互相之间也有明显差别。结论在不同民族,不同种族的Y染色体遗传多态性信息研究中,单个Y-STR的信息量是有限的,但从本研究中可以看到,选择多态性高的多个Y-STR基因座的联合扩增技术在对不同人群的STR多态信息进行调查分析后,显示无论在法医学还是人类遗传学上都有重要意义: 1、多个Y-STR基因座的多态性分析对男性个体所属种族,民族的区分方面具有重要的参考意义。2、多个Y-STR基因座的多态性分析在法医领域的个体识别,父权鉴定,男性家系的鉴别,混合斑中男性成分的鉴定中有显着效果。3、多个Y-STR基因座的多态性分析在人类遗传学中,在民族的迁徙、演变及其来源的研究中,是重要的研究手段之一。此外,对少数民族DNA数据库的完善也有重要补充作用。

巴华杰, 林子清, 李树[5]2007年在《我国东北地区汉族群体11个Y染色体STR基因座的遗传多态性》文中进行了进一步梳理Y染色体为正常男性特有,其95%在减数分裂中呈连锁遗传,因此在法医学中具有其他常染色体基因座不可比拟的独特作用。近年来,Y染色体短串联重复序列(Y-chromosome short tandem sequence,Y-STR)多态性的研究日益受到人们的关注。本文就104名无关男性个体DYS391、DYS389Ⅰ、DYS439、DYS389Ⅱ、DYS438、DYS437、DYS19、DYS392、DYS393、DYS390、DYS385a/b11个Y-STR基因座及其单倍型的分布进行了调查,并对其在法医学中的应用价值进行了探讨。

冯常俊, 相志德, 申成斌[6]2005年在《河南汉族人群12个Y-STR基因座的遗传多态性》文中研究指明目的调查12个YSTR基因座及其单倍型在河南汉族人群中的遗传多态性分布。方法应用PowerPlexYSystem,系统对河南汉族200名无关男性个体进行检测分析,并统计其群体遗传学参数。结果12个YSTR基因座共检出195种单倍型,其中191种单倍型出现1次,1种出现3次,3种出现2次。累积GD值:0.9988。结论12个YSTR基因座具有较强的个体识别能力,可应用于河南地区个人识别和亲权鉴定。

刘超, 陈玲, 陈晓辉, 刘长晖, 王慧君[7]2007年在《广州汉族人群12个Y-STR基因座多态性及法医学应用研究》文中研究说明目的研究广州地区汉族人群12个Y-STR基因座的等位基因频率分布、单倍型遗传多样性及其法医学应用价值。方法采用PowerPlexYSystem荧光标记复合扩增系统检测401例广州汉族无关个体的12个Y-STR基因座,并用3100遗传分析仪进行基因分型。结果获得了广州地区汉族无关男性个体的12个Y-STR基因座的频率分布资料,观察到398个单倍型,其基因多样性为0.99997;检测13种动物血样,在特异性区域均无扩增产物;55个父系样本,未观察到突变基因;同一男性个体的不同组织基因分型相同且女性DNA成分不影响Y-STR的扩增分型。结论该12个Y-STR基因座检测系统具有很高的识别能力,在群体遗传学研究及法医学混合检材的个人识别和父系亲缘关系鉴定中有重要应用价值。R

王克杰, 武红艳, 杨卫红[8]2010年在《河南汉族人群16个Y-STR基因座遗传多态性》文中认为本文对河南汉族人群16个Y-STR基因座的多态性进行了调查,旨在为法医学应用和群体进化研究提供基础数据。1材料与方法1.1样本与检测283份河南地区汉族无关个体血样为郑州市公安局日常检案积累。常规Chelex-100法提取模板DNA。10μL复合扩增体系

陈悦康, 李茜, 李大成, 邓志辉[9]2008年在《南方汉族无关男性群体17个Y-STR基因座单倍型遗传多态性的研究》文中指出目的研究中国南方汉族无关男性群体中DYS426等17个Y-STR基因座的遗传多态性,以应用于法医学鉴定。方法采用AmpFlSTR YfilerTMPCR复合扩增试剂盒和ABI PrismTM3100基因测序仪荧光检测方法,检测119份无关男性个体血样,调查南方汉族的17个Y-STR基因座的单倍型频率,并计算单倍型遗传多样性。结果在119份无关男性样本中,共检出118种Y-STR单倍型,其中117种单倍型仅出现1次,另一单倍型15/12/23/28/16/15/13,13/13/10/11/20/14/12/14/10/18出现2次,单倍型多样性达0.9999。结论AmpFlSTR Yfiler复合扩增试剂盒所包含的17Y-STR基因座,在南方汉族无关男性个体中具有丰富的遗传多态性和较高的非父排除能力,在法医学个体识别和亲子鉴定中具有广泛应用价值。

陈慧锦, 蒲红伟, 胡佳, 王伟, 张丽萍[10]2011年在《新疆巴州维吾尔族17个Y-STR位点遗传多态性》文中研究说明目的:调查17个Y染色体短串联重复序列(Y-Short tandem repeat,Y-STR)基因座及其单倍型在新疆巴州维吾尔族人群中的分布情况。方法:应用AmpFlSTR YfilerTM荧光标记复合扩增系统,对149名维吾尔族无关男性个体血样进行17个Y-STR位点的复合扩增,用ABI 3130XL遗传分析仪对扩增产物进行检测分析。结果:DYS456、DYS389Ⅰ/Ⅱ、DYS390、DYS458、DYS19、DYS385a/b、DYS393、DYS391、DYS439、DYS635、DYS392、Y-GATA-H4、DYS437、DYS438、DYS448各位点遗传多样性(Genetic diversity,GD)值分布在0.498 2~0.948 5之间;17个Y-STR位点共观察到单倍型148种,其单倍型多样性(Haplo-type diversity,HD)值为0.999 86。结论:新疆巴州维吾尔族17个Y-STR位点具有丰富的遗传多样性,可为父权鉴定和父系进化研究提供有价值的遗传学资料。

参考文献:

[1]. 南昌汉族人群DYS19、DYS390基因座遗传多态性[J]. 龚志强, 孙小妹, 刘炯, 许小明, 冯琼. 法医学杂志. 2004

[2]. 南昌汉族人群DYS19、DYS390基因座遗传多态性研究[D]. 孙小妹. 江西医学院. 2004

[3]. 江苏地区汉族人群23个Y染色体STR基因座的多态性[J]. 马骏, 朱爱华, 石津玮, 金明, 巴华杰. 中国医学科学院学报. 2017

[4]. 广西10个少数民族Y染色体17个STR基因座的遗传多态性[D]. 梁祚仁. 广州医学院. 2009

[5]. 我国东北地区汉族群体11个Y染色体STR基因座的遗传多态性[J]. 巴华杰, 林子清, 李树. 法医学杂志. 2007

[6]. 河南汉族人群12个Y-STR基因座的遗传多态性[J]. 冯常俊, 相志德, 申成斌. 刑事技术. 2005

[7]. 广州汉族人群12个Y-STR基因座多态性及法医学应用研究[J]. 刘超, 陈玲, 陈晓辉, 刘长晖, 王慧君. 南方医科大学学报. 2007

[8]. 河南汉族人群16个Y-STR基因座遗传多态性[J]. 王克杰, 武红艳, 杨卫红. 中国法医学杂志. 2010

[9]. 南方汉族无关男性群体17个Y-STR基因座单倍型遗传多态性的研究[J]. 陈悦康, 李茜, 李大成, 邓志辉. 实验与检验医学. 2008

[10]. 新疆巴州维吾尔族17个Y-STR位点遗传多态性[J]. 陈慧锦, 蒲红伟, 胡佳, 王伟, 张丽萍. 重庆医科大学学报. 2011

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