基于基因数据库分析CBΧ2在非小细胞肺癌中的表达及临床意义论文_秦丽丽(通讯作者)

(大理大学基础医学院 云南 大理 671000)

【摘要】目的:探讨CBΧ2基因在NSCLC中的表达及临床意义。方法:检索Oncomine数据库中关于CBΧ2在不同NSCLC队列中的信息,并对其进行荟萃分析,结合Kaplan-Meier Plotter数据库进行NSCLC患者生存周期分析。结果:在Oncomine数据库中共有13项研究包含1896个样本涉及比较CBΧ2在NSCLC组织与正常组织中的表达。与正常组织相比,CBΧ2在NSCLC中高表达(P<0.05),并且高表达CBΧ2的患者总体生存时间较低表达者短,预后较差(P=0.0027)。结论:CBΧ2在NSLCL组织中高表达,且与NSCLC预后呈负相关,这为进一步深入研究奠定基础,也可能为抗肿瘤药物的研发提供潜在靶点。

【关键词】非小细胞肺癌;CBΧ2;Oncomine数据库

【中图分类号】R730.4 【文献标识码】A 【文章编号】2095-1752(2019)10-0022-02

Expression and clinical significance of CBΧ2 in non-small cell lung cancer: an analysis based on data-mining of gene databases

Qin Lili. College of Basic Medicine, Dali University, Dali, Yunnan, 671000, China

【Abstract】Objective This study aimed to explore the expression and clinical significance of CBΧ2 gene in NSCLC. Method The data of CBΧ2 expression in different NSCLC cohorts were retrieved from Oncomine database, and the relationshipbetween the expression of CBΧ2 and the survival status of NSCLC was retrieved from an online survival analysis tool “Kaplan-Meier Plotter” database. Result In Oncomine database, a total of 13 studies were involved CBΧ2 in NSCLC tissues and normal tissues, including a total of 1896 samples. Overall, CBΧ2 expression in NSCLC is higher than in normal tissue (P<0.05).Moreover, Kaplan- Meier plots of overall survival indicated that patients with high expression of CBΧ2 closely associated with poor survival in NSCLC (P=0.0027).Conclusion The expression of CBΧ2 is up-regulated in NSCLC tissue, which is correlated with poor prognosis. And highly expressed of CBΧ2 provides the basis for exploring the role of CBΧ2 in NSCLC, which also may be considered as a marker for prognostic studies of NSCLC.

【Key words】Non-small cell lung cancer; CBΧ2; Oncomine database

肺癌在全世界发病率极高,在美国肺癌致死率排在癌症病死率的首位,其中非小细胞肺癌(non-Small cell lung cancer,NSCLC)占大多数[1]。尽管近年来肺癌相关诊疗方法日益进步,但确诊时患者大多已处于中晚期,预后仍未得到显著改善。色素框同源物(Chromobox protein homolog,CBX) 是多梳蛋白家族(Polycomb grouPproteins,PcG)的重要成员,PcG家族是一种表观遗传调控复合物,以聚合转录抑制复合体的形式存在,在调控细胞周期、细胞信号转导及肿瘤发生等方面发挥着重要作用[2]。其中CBΧ2基因活性与细胞周期依赖性调节相关,并在肿瘤的发生、发展中发挥着重要作用[3]。Oncomine数据库是目前全球最大的癌基因芯片数据平台,可以方便地进行靶基因差异表达挖掘分析。本研究利用该数据库及Kaplan-Meier Plotters数据库,通过二次荟萃分析CBΧ2在NSCLC中的表达及对预后的影响,为进一步研究其促进NSCLC恶性进展的作用机制提供线索并奠定理论基础。

1.材料和方法

1.1 Oncomine数据库提取数据

登录Oncomine数据库(https://www.oncomine.Org/),在该数据库中设定检索条件后提取数据。设定的筛选条件具体如:①“Cancer Type: Lung cancer”;②“Gene: CBΧ2”;③“Data Type: mRNA和DNA copy number”;④“Analysis Type:Cancer vs Normal Analysis”;⑤临界值设定条件Pvalue<1E-4,fold change>2,gene rank=toP10%。

1.2 Kaplan-Meier Plotter进行患者生存周期分析

登录Kaplan-Meier Plotter数据库(http://kmplot.com/analysis/)对NSCLC数据集进行在线生存分析。设定筛选条件如下:①“Cancer: Lung Cancer”;②“Gene: CBΧ2”;③“Survival: OS”。

1.3 统计学方法

正常组织与NSCLC组之间CBΧ2表达差异采用t检验。CBΧ2表达与NSCLC预后的关系采用Kaplan-Meier模型分析。所用数据采用Oncomine 数据库和Kaplan-Meier Plotter 数据库在线统计学分析,P<0.05 认为差异具有统计学意义。

2.结果

2.1 CBΧ2在NSCLC中的表达结果

自2001年开始在Oncomine数据库中共有13项研究涉及比较CBΧ2在 NSCLC组织和正常组织中的表达,共有1896个样本,包括肺腺癌、鳞癌及大细胞肺癌与正常组织比较。文章分别发表于PNAS、Cancer research、science translational medicine、PLoS One等杂志。荟萃分析13项研究结果发现:与正常组织相比,CBΧ2基因在NSCLC中高表达(P=2.93e-7)(图1)。

图3 Kaplan-Meier Plotter 数据库分析CBΧ2对非小细胞肺癌患者预后的影响

3.讨论

肺癌是全世界最常见的恶性肿瘤之一,每年全球约有159万患者死于此疾病,其中非小细胞肺癌是最主要的组织类型约占85%[7]。晚期NSCLC标准一线治疗含铂两药联合方案化疗虽可延长生存期,但疗效不尽人意。随着精准医疗时代的到来,NSCLC 的治疗方案由传统化疗发展为个体化精准治疗。虽近几十年基于EGFR、ALK、ROS1 等肺腺癌驱动基因的靶向药物极大地改善了肺腺癌患者的生存预后,但这些基因的突变仅存在于部分患者中[8]。因此,寻找NSCLC的新靶点,对于研发治疗肺癌的新靶向药物具有重要的临床意义。多项研究表明多梳蛋白家族成员CBΧ2在肿瘤的恶性进展中发挥着重要作用。Chen等[9]通过对455例乳腺癌组织标本进行免疫组化分析发现CBΧ2在乳腺癌中的表达水平明显高于癌旁组织,并且其异常高表达与乳腺癌的分期晚及预后不良相关。Clermont等[10]研究发现在转移性前列腺癌和去势抵抗性前列腺癌中CBΧ2异常高表达,揭示了CBΧ2能控制细胞增殖和转移的许多关键调控因子的表达,从而促进其恶性增殖和侵袭转移能力。目前CBΧ2与肿瘤的研究仍处于初步阶段,其作用及机制仍需进一步探索。本文只是基于数据库大样本量对基因表达水平进行分析,缺乏对蛋白水平的进一步验证.可以明确的是CBΧ2的表达与NSCLC患者预后相关,但其作用机制需要进一步的实验证明。

综上所述,我们通过对基因数据库中肿瘤CBΧ2基因与NSCLC的相关信息深入挖掘分析,提示CBΧ2在NSCLC组织中高表达,且与NSCLC预后相关。本文结果为探索CBΧ2影响NSCLC进展机制奠定了理论基础,同时CBΧ2的表达在一定程度上可作为反映NSCLC预后的重要生物标志物,可能为NSCLC早期诊断、判断预后和治疗提供临床依据。

【参考文献】

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[8]宋勇,高健伟.精准医学时代的晚期非小细胞肺癌内科治疗进展[J].医学研究生学报, 2017, 30(11):1121-1127.

[9] Chen WY, Zhang XY, Liu T,et al.Chromobox homolog 2 protein:A novel biomarker for predictingprognosis and Taxol sensitivity inpatients with breast cancer[J]. OncolLett, 2017, 13(3):1149-1156.

[10] Clermont PL, Crea F, Chiang YT,et al.Identification of the epigenetic readerCBΧ2 as a potential drug target inadvanced prostate cancer[J]. ClinEpigenetics, 2016,8(1):16-30.

通信作者:秦丽丽,E-mail: veritasdoct168@163.com

论文作者:秦丽丽(通讯作者)

论文发表刊物:《医药前沿》2019年10期

论文发表时间:2019/5/28

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基于基因数据库分析CBΧ2在非小细胞肺癌中的表达及临床意义论文_秦丽丽(通讯作者)
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