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一、任期内所在单位财务收支审计
１．财政性资金的管理和使用审计。财政性资金是否按照规定用途、范围、标准使用，有无隐瞒、挪用、截留或设置账外账、小金库等，是否存在账外收支等事项，财政部门拨付的奖贷基金有无挤占、挪做它用等，经费支出是否有超标准、超范围现象，是否存在公款报销个人消费、领取额外报酬、超标准购置设备／交通工具等违规行为。是否存在以娱乐、餐饮（高消费）及连号等不合规发票报销现象，经营性收入及个人应纳税收入是否按税法规定足额提取和按时缴纳。
２．创收资金的管理和使用审计。高校鼓励各单位创收的资金，是否全部入账，是否符合国家和院校的有关规章制度，创收的分配情况如何，有无截留、隐瞒等现象，创收的发展前景如何。这是审计的重点，因为高校各部门的创收在很大程度上是组织和利用本院校的人力、物力、财力等公共资源进行经营，要看是否有效配置了这些经济资源，是否有“搭便车”现象，是否以损害公共资源为代价获取本部门利益，是否承担起提高本院校资源的生产经营效率和利用率的责任，有无存在造成国家资源重大浪费的风险或潜在可能性。
二、任期内所在单位资产、负债、净资产审计
１．货币资金、固定资产、材料、教材、低值易耗品、耗材、应收款项等，关系到国有资产的真实、完整、安全和有效利用，是评价高校领导干部经济责任履行情况的重要内容。这主要包括资产的产生是否合法合规，是否存在经济业务已经入账，而实际资产并不存在。
２．资产的保管是否完整，是否存在实际的资产以前存在，现在已不存在，是否经常对有形资产进行盘点，是否对应收款项定期进行核对，是否及时清理呆死账及无法偿还的债务。
３．资产的领取是否合规，资产领取人的签字及实物的存在是否核准，资产领取人是否对资产起到监督、鉴证的作用。
４．资产的使用是否有效，是否存在国有资产的闲置、浪费现象。资产的有效使用率是否较以前提高，资产完整率、不良资产比率、资产损失比率是否控制在正常限度内。
５．高校超常规发展所需大额借款手续是否合法，到期贷款是否及时偿还，借款资产的使用是否得当，专项借款有无挪用，是否存在违反大额资金使用用途的内部转移。
６．净资产的变动（职工福利基金、学生奖贷基金、事业基金、固定基金、专项资金等）是否真实、合理，有无不符合此项目的经济业务账务处理。
三、任期内重大或主要经济决策审计
决策是高校领导干部最具代表性的特征，是为了本单位的良性发展而作出的决定。决策的质量直接关系到该单位未来的发展方向，表露出单位领导干部的能力，是领导干部任免、升迁和奖励的重要标准。决策优劣受三个方面的影响：决策模糊性（主要指决策程序）、自主决定权和责任感。经济决策审计时要看是否有违反决策程序、滥用职权、暗箱操作等方面的问题，要看是否有论证不足、盲目决策、效率低下情况，要看本部门津贴分配与奖惩是否合理，公平与效率是否到位等问题。通过比较任期内主要决策制定率与决策成功率，判断领导干部制定决策的果断性和准确性，通过分析决策对未来产生的效益状况，把握领导干部决策的责任目标前景。
四、任期内内部控制和风险管理审计
１．应审计内控制度。内部控制是为了维护财产物资的安全完整、保证会计信息的真实有效和相关法律规章的遵从性而形成的内部管理机制和自律系统。审计的内容主要包括内部控制的合法合规性，看内部控制的布局是否合理，有无多余或低效率的控制，是否接受政策约束；内部控制的健全性，看是否建立强有力的关键控制点，已建立内部控制数与完善的内部控制数之间的差距在哪些方面，是否将政策予以贯彻执行；内部控制制度的执行情况，看已制定的管理制度是否落实，其产生的实际效果如何，已建立的内部控制制度是否有利于责任目标的有效实现。通过调查、实际取证来比较实际执行的内部控制与已制定的内部控制，评价内部控制制度的执行效益。
２．审计风险管理。风险管理是内部控制的基础，风险的存在是为了创造更好的信息和分析工具以完善内部控制，内部控制的完善则为了更好的处理已知或未知风险。内部控制制度反映了领导干部的管理水平，而风险因素暴露出单位内部控制机制中存在的控制薄弱环节。单位领导干部只有将内部控制与风险管理相融合，才能在本质上提高内部控制的效果。