牡丹江医学院生物化学与分子生物学教研室
摘要：目的 研究Rbbp5在前列腺癌组织中的表达与意义，为临床前列腺癌的诊治提供标志分子及靶标。方法 采用生物信息学方法，基于TCGA数据库中前列腺癌和癌旁组织的测序数据，比较在前列腺癌和癌旁组织中Rbbp5的表达，检测不同年龄段和不同种族间及与癌旁组织相比Rbbp5的表达差异。结果在癌旁组织表达高于前列腺癌组织，在不同年龄段无差异，高加索人前列腺癌组织中Rbbp5的表达高于癌旁。结论 前列腺癌组织中Rbbp5的表达增加，前列腺癌组织中Rbbp5的表达与年龄无关，高加索人前列腺癌组织中Rbbp5的表达高于癌旁组织。结论 Rbbp5在前列腺癌中低表达，与年龄无关，高加索人前列腺癌组织中Rbbp5的表达增高。
前言
前列腺癌是成年男性多发的恶性上皮肿瘤。随着生活方式和水平的进步，检测手段的进步，其发病率逐年增加。前列腺癌欧美多发，而我国的新发病例近年来呈逐年增加趋势。
前列腺癌的治疗方法包括手术、化疗、放疗等。最常用的治疗方法是雄激素剥夺疗法，失败后，多导致雄激素抵抗。迫切需要更加准确敏感的诊治方法和作用靶点。
生物信息学是近年发展起来的新学科。能够利用计算机技术分析生物学大数据，成为一个筛选验证合适的生物标记物和治疗靶点的新方法。
我们采用生物信息学技术，检测了Rbbp5在前列腺癌和癌旁组织的表达。
材料与方法
材料
所有前列腺癌组织与癌旁组织RNA测序数据来自于TCGA数据库（http：//www.tcga.org/）。其中前列腺癌组织497例，癌旁组织52例。40-60岁222例，60-80岁273例。高加索人147例，非裔美国人6例。
方法
采用文献的方法[1]，即UALCAN（http：//ualcan.path.uab.edu.）。在线分析TCGA的数据。基于Perl-CGI、javascript和css搭建。可以迅速快捷的获得TCGA的肿瘤表达谱数据。提供所学基因或基因组的基因资料超链接（GTEx、The human protein atlas、GeneCards、Pubmed、HPRD、OpenTargets等。）能够提供基因表达、相关性分析、生存分析等。
结果
1.Rbbp5在前列腺癌组织中的表达
为了评估Rbbp5的表达在前列腺癌组织中的作用和意义，我们利用TCGA数据库中Rbbp5的表达谱数据，与癌旁组织的表达相比。结果表明Rbbp5在前列腺癌组织中的表达显著低于癌旁组织（P= 0.0044203）。结果如图1。表明Rbbp5的表达减少可能是前列腺癌发生发展的始动因素。
图3 Rbbp5在高加索人和非裔美国人前列腺癌组织中的表达
讨论
前列腺癌是困扰广大男性的恶性肿瘤，起病隐匿，不易检测，发现时已多为晚期。临床迫切需要敏感的分子诊断标志和准确的治疗靶点。
我们采用TCGA数据库中的前列腺癌RNA测序结果，与癌旁组织比较，发现Rbbp5的表达降低，表明在前列腺癌中Rbbp5可能起抑癌基因的作用，可能成为前列腺癌诊断和治疗的靶点。接着我们又检测了不同年龄组的前列腺癌组织之间以及不同年龄组的前列腺癌组织与癌旁组织之间的Rbbp5表达，结果发现没有显著性差异，表明Rbbp5的表达在前列腺癌组织中无时间特异性。最后我们又检测了不同种族前列腺癌组织之间以及不同种族组的前列腺癌组织与癌旁组织之间的Rbbp5表达，结果表明在高加索人即美国白人的前列腺癌组织Rbbp5的表达高于癌旁组织。而其他组之间没有显著性差异。而流行病学研究发现高加索人中的前列腺癌发病率是较高的，可能与该种族人群的基因差异相关。
在人类的细胞中，研究结果显示，由等组分的Rbbp5、WDR5和SET1、MLL1/2、MLL3/4三种具有催化活性的酶共同构成COMPASS（Complex Proteins Associated with Set1，COMPASS）或 COMPASS样复合体（其中Rbbp5是存在于所有类型 COMPASS 复合体中的保守组分），其主要作用是催化H3K4Me3生成[2]。以往研究中已经证实Rbbp5表达的变化能够调控Snail 基因启动子中H3K4Me3修饰的变化，影响Snail的表达水平，从而促进前列腺癌EMT进程[3]。而我们的研究结果表明Rbbp5在前列腺癌组织中低表达，本文是基于TCGA数据库RNA转录谱数据得到的结论，此结果还需要在更大的样本量中做进一步的研究。
总之，本文阐述了在前列腺癌组织中Rbbp5的表达低于癌旁组织，并且与年龄无关。高加索人前列腺癌组织的Rbbp5表达高于癌旁。
参考文献：
[1]Chandrashekar DS，Bashel B，Sah B，Creighton CJ，Ponce-Rodriguez I，Bvsk C，Varambally S.UALCAN：A Portal for Facilitating Tumor Subgroup Gene Expression and Survival Analyses.Neoplasia.2017；19（8）：649-658.
[2] Eissenberg JC，Shilatifard A.Histone H3 lysine 4（H3K4）methylation in development and differentiation.Dev Biol.2010 Mar 15；339（2）：240-9.
[3] Li D，Sun H，Sun WJ，Bao HB，Si SH，Fan JL，Lin P，Cui RJ，Pan YJ，Wen SM，Zheng XL，Yu XG.Role of Rbbp5 and H3K4me3 in the vicinity of Snail transcription start site during epithelial-mesenchymal transition in prostate cancer cell.Oncotarget.2016 Oct 4；7（40）：65553-65567.
基金项目：黑龙江省大学生创新创业训练计划；项目编号：201810229024
论文作者:翟淑文,季琳,张桂林,牛天李,杨龙辉,崔荣军（通讯
论文发表刊物:《健康世界》2019年13期
论文发表时间:2019/10/28
标签：前列腺癌论文; 组织论文; 高加索论文; 高于论文; 基因论文; 方法论文; 差异论文; 《健康世界》2019年13期论文;