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企业合并会计报表审计，关键是审查企业对财务报告的审核与调整。此项审查应做好三项工作，即核实企业对财务报告的审核和调整是否合理合法，包括会计期间调整和会计报表折算是否准确，重大关联交易是否核对相符等；核实未经审计人员审计的企业资产、负债和损益；根据审计核实结果对企业财务报表进行调整。审查对象是集团本部和企业所有的被投资企业（或项目）的财务报告，以及企业编制的合并会计报表工作底稿。要审查控股企业对被投资企业财务报表调整的标准及其合理合法性，注意应调整但企业未调整的项目和不应调整但企业已调整的项目。企业编制的合并工作底稿，往往是不全面，或缺少应纳入但未纳入合并范围企业资料，或缺乏非控股企业调整资料，审计人员应结合审查合并范围，对企业审核和调整工作进行审查。审查的常用方法有以下两种。
第一种，是按以下步骤逐项进行审查
（１）审查确定企业统一的财务报告折算汇率。企业一般应采用会计年度末市场汇率中间价作为折算汇率，且应与以前会计年度相一致。否则，应要求企业说明原因及其影响。
（２）审查财务报告截止日和会计期间。一般情况下，企业会计期间与日历年度一致。控股企业出于管理需要，往往要求所属企业采用统一的财务报告截止日。重点应审查企业有无故意调整财务报告截止日的情况，是否存在多计资产少计负债的情况，注意对应纳入合并范围但未纳入的企业财务报告，以及可不纳入合并范围但应按权益法核算的企业财务报告，进行审查和调整。
（３）审查企业对会计政策的调整。应审查调整的原因，确定具体调整事项，及其对合并会计报表的影响。
（４）审查企业对财务报告的外币折算。内部长期股权投资、实收资本、资本公积和盈余公积，应采用历史汇率进行折算；其他项目应采用企业根据年末汇率中间价等确定的统一汇率进行折算。折算差额应在合并会计报表单独列示。
（５）审查企业内部投资、往来和关联方交易。审查的方法，分别编制应纳入合并范围企业审计工作底稿和其他被投资企业审计工作底稿。前者反映企业应纳入合并范围的投资成本、应收应付款、已计提减值准备，以及相应的合并抵销金额等。后者反映除应纳入合并范围企业外所有其他投资成本、应收应付款、累计盈亏、应占被投资企业损益、应计提减值准备和已计提减值准备等。通过编制上述审计工作底稿，既能理顺企业内部往来，加强对自主编制的合并审计工作底稿的稽核，并与企业编制的相应工作底稿相互核对，顺利完成审查任务，又能为正确编制合并抵销分录打下基础。
（６）审核企业集团中未审计的企业资产、负债和损益。应对未经审计的企业会计报表截止日固定资产计价和折旧、无形资产计价和摊销，以及大额债权债务的真实性、合法性和完整性等进行审核。
（７）调整财务报表。审计调整要达到两个目标，一是如实反映企业资产、负债和损益及其结构比例，二是为审查或编制总额抵销分录打好基础。在完成上述审查步骤的基础上，应综合考虚企业财务、经营决策以及相应的损益分配政策，根据《公司法》、《会计法》和《企业会计制度》的相关规定，调整和确认企业财务报表。同时，按照编制合并审计工作底稿的要求，将企业权益性投资和往来等会计报表项目，按照流动性和非流动性、短期和长期、集团内部和外部等标准，分别调整计入下列合并审计工作底稿项目：投资附属企业、投资合营企业、投资联营企业和其他投资，控股企业投资和最终控股企业投资，应收应付附属企业和应收应付联营企业，应收应付控股企业和应收应付最终控股企业，内部销售收入和内部销售成本，计提投资减值准备和计提应收减值准备等。
第二种，是充分收集被审计单位编制的合并工作底稿和相关资料，充分利用社会审计成果。企业在审核和调整财务报告过程中，应编制多种工作底稿，留下编制轨迹。审计人员应注意收集相关资料，根据企业编制轨迹，注意发现企业编制过程中存在的恶意粉饰会计报表和乱编合并会计报表等重大问题。
在合并会计报表审计中，除了审查企业对财务报告的审核与调整，还要审查合并会计报表范围，以及企业投资核算方法。
审查合并会计报表范围。凡投资企业能合法地控制被投资企业的财务、人事和经营等重大决策，则应纳入合并范围。怎样确定“合法地控制”呢？一种情况是绝对控股，即占股比例５０％以上。另一种情况是共同控股，即两个或两个以上股东占投资企业股份相等，例如２个股东各占股５０％，３个股东各占３３．３３％等。这时，企业应将被投资企业资产、负债和所有者权益，按控股比例纳入合并范围。第三种情况是相对控股，即虽占股５０％以下，但拥有的表决权数占总表决权数的相对多数。
审查企业投资核算方法。上市公司长期投资按权益法核算，短期投资按成本与市价孰低法核算；非上市公司投资占股金２５％以下按成本法核算，２５％以上按权益法核算；共同控股按权益法核算。企业是否已经在会计核算过程中分别按权益法或者成本法核算对外投资，对企业正确编制合并会计报表影响不大，只需在编制阶段做适当调整即可。应结合审查企业合并范围，确定企业哪些投资应按权益法核算，哪些投资应按成本法核算，哪些投资应按成本与市价孰低法核算，并根据审计确认结果，审查企业编制的合并工作底稿，审查企业是否在合并工作底稿中对投资进行了适当的调整。
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