Nested PCR检测微量隐孢子虫卵囊的研究及其应用

Nested PCR检测微量隐孢子虫卵囊的研究及其应用

李贝贝[1]2017年在《心智加工套迭作为一种研究思想呈现的新视角》文中研究表明传统的思想呈现研究类比言语呈现,侧重模式的范畴化,分析不同模式的特征和效果,忽视了思想不同于语言的认知复杂性。思想的认知复杂性表现之一就是心智加工套迭。所谓的心智加工套迭在本文中指内部嵌套了几层心智加工的心智加工可以进一步从心智上被加工的现象。心智加工套迭现象作为心智理论的一部分虽被某些学者所关注,它的语言表征却尚未得到充分研究。本文建立了心智加工套迭的认知模型,包括叁个要素:心智加工层,心智加工者和心智活动。心智加工的对象可以是非心智内容也可以是心智内容,后者将会嵌套另一层心智加工。心智加工包括感知、认知和情态。情态助动词和其他心理动词一起作为一层心智加工。心智活动可以被进一步进行心智加工,层层套迭。心智加工套迭现象存在于语言中,特别是小说中,因为人物经常会对自我或他人的心智状态进行推测和加工。心智加工套迭根据嵌套层数可以分为一层心智加工,两层心智加工和叁层心智加工等。根据心智活动的种类不同,可以分为感知加工套迭,认知加工套迭,情态加工套迭以及混合型心智活动套迭。实施心智加工动作的主体称为心智加工者,可以是同一主体或多个主体进行嵌套。本文主要研究心智加工套迭在语言层面的表征,包括指示语,心智词汇,时态、体态和语态,情态以及嵌套的小句结构,以对《达洛维夫人》语料的案例定性分析,验证心智加工套迭的认知模型的解释力,为思想呈现提供新的研究材料和方法借鉴。本文有四个主要发现。一、心智加工套迭在《达洛维夫人》中大量存在。二、此认知模型至少可以用来分析《达洛维夫人》中的心智加工套迭现象。叁、非动词也可以是心理词来占据心智加工一层。心理词“thought”经常出现,提醒读者呈现出来的是谁的心智加工。过去时和过去完成时是主要时态来讲述发生在过去的故事。低阶层不仅可以是高阶层的直接宾语,也可以是高阶层的从句。四、从心智加工套迭的视角研究思想呈现的研究是可行的。

邱丽芳, 刘宁宁, 陈明坤, 岳鑫[2]2018年在《Nested-LET柔性铰链设计与性能分析》文中研究说明针对平面折展机构中柔性铰链在承受拉压载荷时变形大、转动精度差等问题,基于外LET铰链和嵌套结构的方法,提出了一种Nested-LET柔性铰链。设计了该铰链的结构,利用等效弹簧模型推导了其弯曲及拉压等效刚度计算公式并给出了修正系数。通过设计实例的理论计算和仿真分析,验证了理论分析的正确性和设计的可行性。比较了相同尺寸的Nested-LET与外LET铰链的弯曲性能与抗拉性能,结果表明,Nested-LET铰链弯曲刚度增加了1.5倍,拉压刚度提升了30倍,且转动中心漂移量有所下降。最后,通过拉伸实验验证了分析的正确性。

谢丽雪, 郑姗, 张立杰, 张小艳, 李韬[3]2016年在《蓝莓休克病毒IC-RT-nested PCR检测技术》文中研究表明【目的】蓝莓休克病毒(Blueberry shock virus,BlShV)是蓝莓上主要病毒之一,侵染蓝莓后能够对其产量造成严重影响。研究旨在建立用于BlShV快速检测的IC-RT-nested PCR技术,为该病毒的检测鉴定提供可靠的技术手段。【方法】根据GenBank已报道的BlShV基因序列,设计一对外侧引物(BlShV-F/BlShV-R)和一对内侧引物(BlShV-1/BlShV-2),以感染BlShV的蓝莓病叶为材料,利用免疫IC-RT-PCR(免疫捕获RT-PCR)和nested PCR(巢式PCR)建立BlShV的IC-RT-nested PCR检测技术;分别以BlShV、蓝莓焦枯病毒(Blueberry scorch virus,BlScV)、蓝莓带化病毒(Blueberry shoestring virus,BSSV)、蓝莓叶斑驳病毒(Blueberry leaf mottle virus,BLMoV)、烟草环斑病毒(Tobacco ringspot virus,TRSV)、番茄环斑病毒(Tomato ringspot virus,ToRSV)和健康蓝莓叶片为对象,测定该检测技术的特异性;将BlShV第1轮、第2轮PCR产物分别回收纯化后连接到pMD18-T载体,连接产物转化大肠杆菌DH5α后筛选阳性克隆,进行测序和序列比对验证该检测技术的准确性;将感染BlShV的蓝莓病叶提取液用健康蓝莓叶片提取液进行10倍梯度稀释,测定该检测技术的灵敏度,并与DAS-ELISA方法相比较;利用建立的IC-RT-nested PCR对收集的中国福建、吉林、辽宁地区蓝莓叶片样品(53份)和进境美国蓝莓叶片(15份)进行实际检测,并对上述样品采用普通RT-PCR方法进行验证。【结果】建立的IC-RT-nested PCR方法成功从感染BlShV病叶提取液第1轮PCR扩增出约746 bp大小的目的片段,第2轮PCR扩增出约486 bp大小的目的片段,未从健康蓝莓叶片提取液和空白对照扩增出目的片段;特异性测定结果表明,IC-RT-nested PCR具有良好的特异性,仅从感染BlShV蓝莓病叶提取液第1轮、第2轮PCR分别扩增到目的片段,而从BlScV、BSSV、BLMoV、TRSV、ToRSV和健康蓝莓叶片提取液第1轮、第2轮均未扩增到相应的目的片段;序列分析结果显示,感染BlShV蓝莓病叶提取液第1轮、第2轮PCR产物的序列同预期大小完全一致,分别为746、486 bp,将获得的两轮PCR产物序列与GenBank数据库中的BlShV基因序列进行比对,结果显示第1轮、第2轮PCR产物的序列与已报道的BlShV核苷酸序列一致性均达99%,证实两轮PCR产物均为BlShV特异性产物,进一步验证了扩增结果的准确性;灵敏度测定结果表明,IC-RT-nested PCR的第1轮PCR能够检测到稀释102倍的BlShV病叶提取液,灵敏度与DAS-ELISA相当,经过第2轮PCR,灵敏度提高100倍,能够检测到稀释104倍的BlShV病叶提取液;蓝莓样品IC-RT-nested PCR测定结果显示,2份来自于美国的蓝莓叶片样品扩增出大小约486 bp的目的片段,BlShV检出率为13.3%,而中国福建、吉林、辽宁地区蓝莓叶片样品上均未扩增出相应的目的片段,未检测到BlShV,该检测结果与普通RT-PCR验证结果完全相符,表明建立的IC-RT-nested PCR能够用于蓝莓样品的实际检测。【结论】建立的IC-RT-nested PCR具有快速、特异、准确和灵敏的优点,适合于田间和进出境口岸蓝莓样品上BlShV的检测鉴定。

王婧, 毕阳, 朱艳, 韩舜愈, 祝霞[4]2014年在《巢式PCR快速检测西瓜细菌性果斑病菌》文中指出【目的】建立nested-PCR方法,快速检测西瓜种子中的燕麦嗜酸菌西瓜亚种(Acidovorax avenae subsp.citrulli,Aac),为西瓜细菌性果斑病(bacterial fruit blotch of watermelon,WFB)的防控提供技术支持。【方法】根据Aac BOX短重复序列的PCR产物设计两对引物BX-L1/BX-R5和BX-L1/BX-S-R2,建立以BX-L1/BX-R5为外侧引物,BX-L1/BX-S-R2为内侧引物的nested-PCR,以5μL样品处理液于99℃高温裂解10 min,再放置冰上冷却5 min,以所释放病原DNA为模板进行PCR扩增,采用50μL反应体系:5μL 10×PCR buffer(25 mmol·L-1MgCl2),4μL dNTP(D4030RA,2.5 mmol·L-1),引物(5μmol·L-1)各3μL,0.4μL Taq DNA酶(DR001B,5 U·μL-1),通过退火温度优化,反应条件为:引物BX-L1/BX-R5各3μL进行第一轮扩增,95℃,2 min;95℃,30 s;65℃,45s;72℃,1 min;35个循环;72℃,延伸7 min;取扩增后的产物1μL为模板,以引物BX-L1/BX-S-R2各3μL进行第二轮扩增,95℃,2 min;95℃,30 s,66℃,45 s,72℃,1 min,30个循环,72℃,7 min。在此条件下对梯度Aac菌悬液、模拟带菌种子提取液进行特异性、灵敏性及重复性检验,对不同带菌率的西瓜种子提取液进行检测。【结果】引物BX-L1/BX-R5和BX-L1/BX-S-R2在检测不同来源的Aac菌株时都产生了预期大小的片段,并且对其近源种燕麦嗜酸菌卡特莱兰亚种(A.avenae subsp.cattleyae)、魔芋假单胞菌(A.avenae subsp.konjaci)及其不相关菌株未扩增出目标片段。以BX-L1/BX-R5为外侧引物,BX-L1/BX-S-R2为内侧引物的nested-PCR,对Aac纯菌液和模拟带菌种子提取液的最低检测限4.7×101cfu/mL,比direct-PCR灵敏度高出1 000倍。当西瓜种子带菌率在0.1%—0.5%时,nested-PCR阳性检测率为66.7%;当种子带菌率为1%—10%时,nested-PCR的阳性检测率为83%—100%。【结论】以BX-L1/BX-R5为外侧引物,BX-L1/BX-S-R2为内侧引物的nested-PCR方法,能够快速、高效检测携带微量Aac的西瓜种子,检测结果重现性高。

李晓晗, 房立春, 李阳, 崔治中, 常爽[5]2017年在《禽弱毒疫苗中鸡传染性贫血病病毒nested-PCR检测方法的建立》文中研究表明疫苗中污染鸡传染性贫血病毒(CIAV)是造成CIAV感染的途径之一,而通常疫苗中CIAV污染剂量较低,应用一般的技术难以检测到。为了更灵敏地检测禽弱毒疫苗中CIAV的污染,根据Gen Bank已发表的CIAV基因序列,针对其保守区设计了外用引物和内用引物,通过优化反应体系和反应条件建立了检测CIAV的nested-PCR检测方法。结果显示,所建立的检测方法灵敏度比常规PCR高100倍,该方法可以检测到1 000羽份弱毒疫苗中1 EID_(50)的低剂量CIAV污染,应用该方法从送检的50个疫苗样品中检测出4个样品为CIAV阳性。该方法与禽白血病病毒、禽网状内皮组织增生症病毒以及马立克氏病病毒等的基因均无交叉反应,具有很好的特异性。提示所建立的nested-PCR灵敏度高、特异性强,可用于检测禽弱毒疫苗中CIAV低剂量的污染。

刘梦琪[6]2018年在《基于Bootstrap法的城市居民出行行为Nested Logit模型研究》文中提出Nested Logit模型是一种重要的非集计模型,合理准确地对Nested Logit模型进行参数标定对熟悉城市居民出行规律,合理预测交通量,规划城市布局,协调城市交通发展具有十分重要的意义。由于现有Nested Logit模型的主要参数估计方法为同时极大似然估计法和序列估计法,但同时极大似然估计法存在计算复杂的缺陷、序列估计法存在一定的估计方差偏差,因此,本论文将Bootstrap方法运用于Nested Logit模型中,旨在减小模型偏差的同时提高参数估计的有效性。本论文首先介绍了Bootstrap方法,包括其基本思想、常见的Bootstrap方法和Bootstrap方法在回归分析方面的应用;然后介绍了基于活动的出行需求理论基础,提出四阶段法忽略个人出行行为特征的局限性和非集计模型可弥补该缺陷,并介绍了非集计模型的效用最大化理论和出行效用函数等基本理论,同时介绍了常用Logit模型;紧接着建立了城市居民出行行为Nested Logit模型,并提出使用R语言进行模型参数标定;最后以2007年日本东京都市圈居民出行调查为数据基础,分别使用Bootstrap法和序列估计法对Nested Logit模型进行参数标定。结果表明,使用Bootstrap法可减小Nested Logit模型偏差并提高参数估计的有效性。

严若峰, 周金林, 李培英[7]2004年在《4种方法检测牛奶等样品中微量隐孢子虫卵囊的比较》文中研究说明目的 评价4种方法检测牛奶等样品中隐孢子虫卵囊污染情况的应用价值。 方法 利用Nested PCR、PCR、饱和蔗糖溶液漂浮及金胺酚-改良抗酸染色4种方法,分别对36份牛奶、73份奶牛粪便及10份污水样品中鼠隐孢子虫卵囊进行检测。 结果 Nested PCR方法的检出率分别为11.11%、23.29%和0,均高于其他3种方法。结论4种检测方法中,Nested PCR敏感性最高、特异性强、稳定性好,可用于微量隐孢子虫卵囊检测。

陶成南[8]2015年在《基于Nested Lattice编码的多址技术研究与实现》文中研究表明在移动无线通信环境中,频谱资源极其有限,充分合理利用频谱资源,实现通信的高效和可靠传输是现代通信领域研究的主要课题。特别是对于无线局域网,原来的多址是CSMA,随着用户数的急剧增加,当用户过多时,部分用户会由于系统容纳的用户数有限而无法接入到网络内。因此,探寻新的多址接入方式,解决在用户密集区域的接入问题有着重要的意义。本文主要研究了基于Nested Lattice编码的多址接入技术。基于Nested Lattice编码的多址接入技术在发射端采用Nested Lattice编码,接收端采用Nested Lattice译码。即多个用户在发送端采用Nested Lattice编码对信息进行处理后在相同的时频资源上传输,接收端采用串行干扰消除技术结合Nested Lattice译码得到相应的每个用户的信息。但是不同的码本维度、生成矩阵等参数都会影响Nested Lattice编码,从而影响通信系统的性能。针对这些问题,本文将对相关的影响因素进行分析,设计完成基于Nested Lattice编码的多址接入方案。论文首先讨论了Nested Lattice编码和多址接入技术的相关原理。然后根据Nested Lattice编码原理,使用不同的方法以及参数构造Nested Lattice码。并对其性能进行分析。在此基础上,给出了基于Nested Lattice编码的多址接入整体方案,详细介绍了方案中每一部分所使用的技术。最后仿真实现了该方案,给出了相关的性能仿真结果,并对结果进行了分析。

李晓晗[9]2017年在《鸡传染性贫血病毒Nested-PCR检测方法的建立以及不同CIAV母源抗体水平对鸡群保护率的影响》文中研究指明鸡传染性贫血病是一种由鸡传染性贫血病毒(Chicken infectious anaemia virus,CIAV)引起的一种临床上以贫血、骨髓黄染、全身淋巴组织萎缩和免疫机能损害为主要特征的传染病。在全球很多地方已经普遍出现了感染CIAV的家禽,给鸡群造成了极大地危害。除了垂直传播和水平传播外,使用了被CIAV污染的弱毒疫苗是其另一重要的传播途径之一,而通常其中污染的CIAV剂量较低,需要使用灵敏特异而又快速简便的方法来检测。除综合性生物安全措施外,通过多种途径使雏鸡获得一定水平的母源抗体对于阻止CIAV的感染具有重要意义。本研究建立了针对CIAV的Nested-PCR方法用于弱毒疫苗中CIAV污染的检测并与其它方法开展了对比,此外对不同滴度的母源抗体阻止CIAV感染和致病中的作用做了系统分析。1.鸡传染性贫血病毒Nested-PCR检测方法的建立及应用疫苗中污染CIAV是造成CIAV感染的途径之一,因此加强对禽弱毒疫苗中CIAV污染的监测对于种禽场防控CIAV极其重要,而通常疫苗中CIAV污染剂量较低,应用一般的技术难以检测到。为了检测禽弱毒疫苗中CIAV的污染,本研究根据GenBank已发表的CIAV基因序列,针对其保守区设计了外用引物和内用引物,通过优化反应体系和反应条件建立了检测CIAV的Nested-PCR检测方法。结果显示,建立的检测方法灵敏度高,比常规PCR灵敏度高100倍。该方法与禽白血病病毒、禽网状内皮组织增生症病毒以及鸡马立克氏病毒等病毒基因均无交叉反应,具有很好的特异性。在模拟试验中,该方法可以检测到1000羽份弱毒疫苗中1个EID50的低剂量污染,应用该方法从企业送检的125批次的疫苗样品共检测出6个CIAV阳性样品,从45份病料中共检测出23个CIAV阳性性品,这与荧光定量PCR检测以及PCR结合核酸斑点杂交检测法检测结果基本一致,可以作为这两种方法的补充或替代,为不同实验条件和技术水平的企业提供了更多实用性的选择。2.不同CIAV母源抗体水平对鸡群保护率的影响由于CIAV的感染在国内较为普遍,种鸡场大日龄鸡的抗体阳性率较高,因此就可能通过垂直传播使雏鸡从母鸡体内获得一定滴度的CIAV母源抗体,而母源抗体可以在一定程度上保护雏鸡免受CIAV的感染,但是对于何种抗体水平可以抵抗多少病毒量的感染从未有任何观察数据。本研究通过人工模拟试验模拟了不同CIAV母源抗体水平对鸡群保护率的影响。通过对不同母源抗体滴度的1日龄海兰褐雏鸡分别按照150 EID50、700 EID50、1500 EID50剂量进行攻毒,观察其每周的体重、红细胞数目的变化情况,每周采集抗凝血后提取DNA检测CIAV核酸,采集促凝血分离血清检测CIAV抗体变化。结果显示,对于母源抗体水平较高(15000)的鸡来说,攻毒150 EID50后,体重变化和红细胞数目较正常鸡差异不显着,血液中未检测出CIAV核酸。CIAV抗体随着日龄增长呈现下降状态,在六周内检测CIAV抗体均为阳性,免疫器官指数与正常鸡相比差异不显着。攻毒700 EID50后,体重有轻微减轻的趋势,红细胞数目在前四周出现明显下降趋势,只有个别鸡血液检测出现了CIAV核酸阳性,CIAV抗体滴度随着日龄增长呈下降趋势,在第6周左右接近抗体阳性临界点,免疫器官指数与正常鸡相比出现了差异。攻毒1500 EID50后,体重下降趋势明显,红细胞数目在前四周急剧下降,部分鸡只出现了CIAV核酸阳性,CIAV抗体滴度在第5周下降为阴性。对于母源抗体水平较低(7000)组的鸡来说,在各项指标的检测中相比于母源抗体水平较高的鸡差异更为显着,且高剂量攻毒出现大量死鸡。上述结果证明了高水平的母源抗体滴度可以在一定程度上保护雏鸡免受低毒量的CIAV的感染,但是一旦感染剂量超过一定程度仍然能突破母源抗体的保护使鸡体感染CIAV。

严若峰[10]2001年在《Nested PCR检测微量隐孢子虫卵囊的研究及其应用》文中认为从某奶牛场分离出隐孢子虫卵囊,用金胺酚-改良抗酸染色及饱和蔗糖漂浮后,通过显微镜检,根据其形态、结构、大小等特性鉴定为鼠隐孢子虫(Cryptosporidium muris)。 根据隐孢子虫18s rDNA序列,借助计算机分析,设计并合成出隐孢子虫属特异性和鼠隐孢子虫种特异性引物。在经优化的反应条件和扩增参数下进行聚合酶链式反应,扩增出540bp的片段。初始PCR产物进一步作NestedPCR,扩增出一条250bp的片段。结果表明,该片段是鼠隐孢子虫所特有,以艾美耳球虫、伊氏锥虫、贾第虫、大肠杆菌等病原的DNA为模板进行扩增反应,均无此片段。 Nested PCR具有高度敏感性,可以检测出1个纯化的隐孢子虫卵囊。当样品中卵囊密度高于10个/g(ml)时,该方法亦能很好的检测出。与常规PCR、饱和蔗糖溶液漂浮法及金胺酚改良抗酸染色法比较,Nested PCR的敏感性是常规PCR的10~3倍以上、是漂浮法和染色法的10~5倍以上。 本文还比较了4种卵囊DNA提取方法,结果表明2%二硫苏糖醇冻融法具有很好的敏感性,而且其操作简便,快速易行。 应用Nested PCR技术,对奶牛粪便、牛奶、污水等119个样品隐孢子虫感染及污染情况进行了检测,检出率分别为23.29%、11.11%和0.00%,均高于常规PCR、漂浮法和染色法的检测结果。 综上所述,新建立的Nested PCR技术是一种具有较高特异性和敏感性的微量隐孢子虫卵囊检测方法,具有较好的应用前景。

参考文献:

[1]. 心智加工套迭作为一种研究思想呈现的新视角[D]. 李贝贝. 四川外国语大学. 2017

[2]. Nested-LET柔性铰链设计与性能分析[J]. 邱丽芳, 刘宁宁, 陈明坤, 岳鑫. 农业机械学报. 2018

[3]. 蓝莓休克病毒IC-RT-nested PCR检测技术[J]. 谢丽雪, 郑姗, 张立杰, 张小艳, 李韬. 中国农业科学. 2016

[4]. 巢式PCR快速检测西瓜细菌性果斑病菌[J]. 王婧, 毕阳, 朱艳, 韩舜愈, 祝霞. 中国农业科学. 2014

[5]. 禽弱毒疫苗中鸡传染性贫血病病毒nested-PCR检测方法的建立[J]. 李晓晗, 房立春, 李阳, 崔治中, 常爽. 中国家禽. 2017

[6]. 基于Bootstrap法的城市居民出行行为Nested Logit模型研究[D]. 刘梦琪. 西南交通大学. 2018

[7]. 4种方法检测牛奶等样品中微量隐孢子虫卵囊的比较[J]. 严若峰, 周金林, 李培英. 中国寄生虫病防治杂志. 2004

[8]. 基于Nested Lattice编码的多址技术研究与实现[D]. 陶成南. 西南交通大学. 2015

[9]. 鸡传染性贫血病毒Nested-PCR检测方法的建立以及不同CIAV母源抗体水平对鸡群保护率的影响[D]. 李晓晗. 山东农业大学. 2017

[10]. Nested PCR检测微量隐孢子虫卵囊的研究及其应用[D]. 严若峰. 安徽农业大学. 2001

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Nested PCR检测微量隐孢子虫卵囊的研究及其应用
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