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我国资本市场存在的主要问题
1.资本市场结构严重畸形。近十年来，在市场体系的建设方面出现了将资本市场股市化的倾向，重视证券市场发展，轻视非证券化资本市场发展；重视股票市场发展，轻视和限制债券市场（尤其是企业债券市场）发展；重视交易所场内交易发展，禁止场外交易市场发展，造成资本市场结构严重畸形。
这种畸形市场结构使得资本市场难以扩大。由于受到技术能力和管理能力的限制，交易所的容量不可能无限扩张，大量企业被排斥于资本市场之外；同时因为融资渠道受限，大量企业一窝蜂地涌入股票交易所，来争夺并不均等的融资机会，使市场择优配置资源的机制无从实现。
2.资本市场规模太小，无力满足大规模资产重组带来的交易需求。1999年末，中国股市的市价总值占GDP的比率增长为32.3%，但是与中国台湾(70.9%)、日本(72.7%)、伦敦(125.3%)、中国香港(198.2%)、泰国(88.7%)、新加坡(479.3%)等地相比，这一比率明显偏低。再考虑到我国股票市场有相当大比例的股票不能流通，则股票市场的有效规模就更小，因此资本市场的总体规模不能满足企业融资和资产重组的需求。
市场投机性过强，难以有效配置资源。中国股票市场建立以来，关联交易严重、大机构操纵市场、恶性炒作等问题始终没有解决，导致市场波动性过大，在充满浓厚投机气氛的市场中，上市公司的价格与价值发生严重背离，相当多的股票价格不再以上市公司的经营业绩为基准，甚至出现了劣质企业股价高于绩优股、ST股票受到大力追捧的不正常现象。显然，这样的市场不仅无法吸引追求长期稳定回报的投资者进入，而且也很难发挥引导资金流向、优化资源配置的作用。
采取有力措施，尽快完善资本市场
1.加快中长期信贷市场及企业债券的发展
加快企业债券的发展。在目前通货膨胀率连续保持负数、中央银行基准利率连续下调已达到改革以来的最低点，世界主要国家屡屡降息的情况下，适度扩大债券融资的规模是一个比较理想的时机，应结合大规模基础设施建设和企业兼并重组的需要，适当加快企业债券的发展速度，尽快对企业债券市场做出战略性的规划和具体设计。
加快发展中长期信贷市场。中长期信贷市场发展滞后的根源在于，国有银行在整个银行体系中处于垄断地位，但其改革滞后，效率不高，资产质量低下，要加快中长期信贷的发展，除了加快国有银行改革步伐之外，关键是要尽快打破国有银行的垄断状况，多发展一些股份制形式的民间银行。
2.积极发展场外交易市场
中国资本市场事实上只有交易所一个层次，企业上市严格限于上海和深圳两个证券交易所，但是企业及其融资需求是有层次性的，不是所有的企业都能达到正规交易所上市的标准和条件，也不是所有的企业都想要或适合在交易所上市交易，在“二板市场”的建立短期内不具备条件的情况下，应考虑积极发展场外交易市场。
在市场经济国家，私募资本市场在资本市场体系中发挥着十分重要的作用，大量的资本交易都是通过这个市场进行的。
私募市场的核心是中介机构，这些机构在市场中不仅起着润滑剂的作用，而且有助于保证市场的公正和公平、保障交易双方的合法权益。
但是，中国中介机构的发展现状，无论其素质、服务能力和水平还是资信情况都远远不能满足发展私募资本市场的要求，为规范中介机构行为，保障资本市场的秩序，要加快中介机构与所挂靠政府部门的脱钩工作，使之成为真正独立的、自负盈亏的社团法人，真正按照商业化原则运作，同时要健全法律法规，规范中介机构的业务活动，最后要建立健全社会监督体系，对中介机构的违法违规行为严加惩处。
积极稳妥地发展机构投资者。目前我国证券市场的投资者以散户为主，而追求长期稳定回报的机构投资者发展严重不足，为了促进证券市场的稳定和发展，加强对上市公司经理人员的监管和公司治理结构的改善，应积极稳妥地发展机构投资者。
积极发展投资基金，引导居民转向理性投资。投资基金可以在很大程度上避免个人投资者的投机行为，因为投资基金是由专业理财人士操作，以理性判断为基础，不致于对股市形成很大冲击，加剧股市的动荡。
逐步发挥养老基金在中国资本市场上的重要作用。养老基金具有稳定的资金来源，面对的是相对稳定的现金支付问题，其投资理念更倾向于盈利性、长期性、流动性、安全性的要求，会影响到资本市场中其他投资者的资产组合。促使资本市场向着理性化的方向发展。