齐增湘, 徐卫华, 熊兴耀, 欧阳志云, 郑华[1]2011年在《基于MAXENT模型的秦岭山系黑熊潜在生境评价》文中指出明确物种生境空间分布格局及其与环境因子的关系,对制定合理有效的保护对策十分重要。本文以黑熊(Ursus thibetanus)为研究对象,以其重要栖息地秦岭山系为研究区域,选取68个黑熊分布点数据和34个环境因子,应用MAXENT模型分析其生境空间分布及主要影响因子,以最大化Kappa值的生境适宜性指数为阈值划分适宜生境,结合已建自然保护区进行保护空缺分析,并通过构建阻力面和最小成本路径分析,开展黑熊生境廊道规划。结果表明:人类干扰和土地利用类型是影响黑熊生境选择的主要生态因子,居民点密度、到荒草地距离、到耕地距离3个因子对黑熊生境选择有重要影响,其综合贡献值分别为21.4%、17.5%和15.9%,到阔叶林距离、到水体距离等因子次之。黑熊的适宜生境主要集中分布在秦岭山系主脊的中西部地区,占整个秦岭山系面积的19.23%。空缺分析表明:已建自然保护区群覆盖了23.49%的适宜生境,但尚有8,480km2处于保护区之外。为更有效保护秦岭黑熊及其生境,建议建设12条生境廊道,同时结合其他物种进行系统保护规划。
侯万儒, 陈瑜, 吴夏, 彭正松, 周才权[2]2007年在《四川黑熊(Ursus thibetanus mupinensis)线粒体NADH脱氢酶亚基1基因(ND1)的序列分析》文中研究指明以四川境内的四川黑熊(Ursus thibetanus mupinensis)为研究对象,根据已报道的若干物种的NADH脱氢酶亚基1基因(ND1)序列信息设计引物.运用PCR技术从四川黑熊毛囊组织的总DNA中扩增出ND1基因序列.采用GenScan、Blast2·1、ORF finder和Clustal W等软件分别对DNA序列进行预测、相似性比较、ORF查找以及多序列比对,并利用PredictProtein软件对蛋白质进行预测和结构分析.结果表明;PCR扩增所得DNA序列长度为957bp,包含了ND1基因,其ORF为957bp,编码317个氨基酸,编码蛋白的分子量为35·6×103Da,pI为7·83.四川黑熊的ND1基因序列及其所编码的氨基酸序列与其它熊、浣熊和小熊猫等动物的ND1基因序列和对应的氨基酸序列具有较高的相似性.
郝彦哲, 杜玉杰, 吴夏, 张田, 侯万儒[3]2008年在《亚洲黑熊四川亚种(Ursus thibetanus mupinensis)线粒体ATP合酶和亚基基因克隆及序列分析》文中指出根据已报道的部分哺乳动物线粒体ATP合酶F0亚基的相关信息设计引物,运用PCR技术,首次从亚洲黑熊四川亚种(Ursus thibetanus mupinensis)的肌肉组织总DNA中成功克隆了线粒体ATP合酶F0亚基8(ATP8)和亚基6(ATP6)的序列,并对其进行了初步分析。结果表明:PCR扩增产物的总长度为942 bp,其中842 bp为四川黑熊ATP8和ATP6基因的编码区。ATP8和ATP6基因存在一段长43 bp的重迭区域。ATP8基因长204 bp,编码67个氨基酸残基的蛋白质,其蛋白分子质量为7.9 KD,等电点为10.35;ATP6基因长682 bp,编码226个氨基酸残基的蛋白质,其蛋白分子质量为24.8 KD,等电点为10.63。四川黑熊线粒体ATP合酶F0亚基8和亚基6与其他已报道的部分哺乳动物具有很高的同源性。以基因序列为数据构建的进化树表明四川黑熊和美洲黑熊的亲缘关系最近。本研究为在分子水平上探究黑熊线粒体基因组的遗传特点,探究物种进化关系和物种多样性提供了科学参考。
杜玉杰, 黎云祥, 吴夏, 陈瑜, 侯万儒[4]2007年在《亚洲黑熊四川亚种Ursus thibetanus mupinensis线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅲ基因的克隆与初步分析》文中进行了进一步梳理根据已报道的部分哺乳动物线粒体细胞色素C氧化酶(Cytochrome C Oxidase)亚基Ⅲ基因(mtCOXⅢ)的相关信息设计引物,运用PCR技术,首次从亚洲黑熊四川亚种(以下简称四川黑熊,Ursus thibetanus mupinensis)的肌肉组织总DNA中成功克隆了mtCOXⅢ基因的编码序列,并对其进行了初步分析.结果表明:四川黑熊mtCOXⅢ基因序列全长784 bp,ORF是783 bp,编码261个氨基酸的蛋白质,该蛋白的等电点为6.47,分子量为29840.6 Da.四川黑熊的mtCOXⅢ与已报道的部分哺乳动物的mtCOXⅢ基因具有很高的同源性.进一步分析发现,四川黑熊线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅲ功能位点的位置、种类和数量均与已报道的部分哺乳动物具有很高的相似性.
盛中华[5]2012年在《五种野生动物蛔虫核糖体及线粒体DNA多态性的研究》文中认为蛔虫(Ascaris)隶属于线形动物门、线虫纲(Nematoda)、尾感器亚纲(Phasmidia)、蛔目(Ascaridida)、蛔科(Ascaridae)、弓首科(Toxocaridae)、禽蛔科(Ascaridiidae)以及异尖科(Anisakidae),是寄生于多种脊椎动物小肠内的大型线虫,其中很多种类还可感染人。动物和人感染后,呈现发育缓慢,营养不良,消瘦,贫血及腹痛、腹泻等症状,幼虫的移行还会造成宿主脏器的机械性损伤,在非特异宿主体内还会引起幼虫移行症(larva migrans,LM),严重者造成宿主死亡。蛔虫病呈世界性分布,对人和动物的危害十分严重。以往对蛔虫的研究主要集中在形态描述、生活史及蛔虫病的流行病学调查、诊断和综合防治措施等传统寄生虫学研究方面,利用核糖体序列和线粒体基因对野生动物蛔虫进行分子分类和种系发生的研究还少见报道。采集自然感染斑马(Equus burchelli)、亚洲黑熊(Ursus thibetanus)、非洲狮(Panthera leo)、狼(Canis lupus)和野猪(Sus scrofa)药物驱除虫体,进行形态学鉴定。利用SDS-蛋白酶K方法抽提上述五种野生动物蛔虫的基因组DNA,并依据GenBank上已上传的各蛔虫的基因序列,应用软件Oligo6.0设计5对PCR所用的特异性引物,扩增蛔虫核糖体内转录间隔区(internal transcribed spacer regions,ITS)序列、28S核糖体DNA大亚基(28S ribosomal DNA large-subunit sequences,28S rDNA-LSU)序列、线粒体色素c氧化酶亚基1(cytochrome c oxidase subunit1gene, cox1)基因、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基1(nicotinamide adenine dinucleotide dehydrogenase subunit1gene, nad1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基4(nicotinamide adenine dinucleotide dehydrogenase subunit4gene, nad4),扩增产物经纯化后克隆于pMD18-T载体,分别转化到DH5感受态细胞中,抽提质粒DNA,经双酶切鉴定后,阳性质粒测序。在GenBank上查找蛔虫相关基因序列,应用DNAStar软件比较这5种野生动物体内寄生蛔虫和GenBank上蛔虫相关基因序列的同源性,确定蛔虫的种类。通过对核糖体ITS序列的分析,利用RFLP方法,选用限制性EcoRV和Sal1内切酶对所扩增的寄生于狼和狮的蛔虫核糖体核苷酸序列进行酶切,建立两种相似线虫分子鉴定方法。然后应用Clustal X1.83分子生物学软件对上述的序列进行完全对比并排序,提交引导树,再后使用MEGA4.0, PAUP4.0、Modeltest3.7和MrBayes3.1软件采用最大似然法(Maximum Likelihood methods, ML)、最大简约法(Maximum Parsimony methods, MP)和贝叶斯法(Bayesian)绘制系统发生树。结果显示,斑马、亚洲黑熊、非洲狮、狼和野猪5种野生动物体内蛔虫ITS-1+ITS-2序列长度分别为657bp、703bp、698bp、808bp和752bp,与马副蛔虫、转移贝蛔虫、狮弓蛔虫、犬弓首蛔虫和猪蛔虫的相似度分别为98.3%,98.7%,96.1%,99.8%和99.9%。序列分析结果表明,这5种蛔虫分别为马副蛔虫、转移贝蛔虫、狮弓蛔虫、犬弓首蛔虫和猪蛔虫。PCR-RFLP的鉴别结果与形态学鉴定结果一致,成功的鉴别了犬首蛔虫和狮弓蛔虫。基于核糖体ITS序列,线粒体cox1、nadl和nad4基因,采取ML、MP和Bayesian叁种方法构建的系统发生树结果一致,马副蛔虫、转移贝蛔虫、狮弓蛔虫以及猪蛔虫之间的亲缘关系较近,犬弓首蛔虫与其他四种蛔虫的亲缘关系较远。本研究应用分子生物学手段鉴定了来源于动物园的5种野生动物蛔虫,结果与形态学方法一致。应用PCR-RFLP方法比较相似的狮弓蛔虫和犬弓首蛔虫进行鉴定,建立的方法不但准确高效而且节省了财力。应用核糖体序列ITS和线粒体序列coxl、nadl和nad4等分子标记,采用ML、MP和Bayesian叁种方法对这5种蛔虫进行系统的进化分析,准确地定位了这些蛔虫的进化和分类地位。为进一步的野生动物蛔虫的研究和防治奠定了基础。
杜玉杰, 侯怡铃, 侯万儒[6]2010年在《亚洲黑熊四川亚种线粒体NADH脱氢酶亚基5和亚基6基因的克隆与初步分析》文中进行了进一步梳理[目的]克隆与分析亚洲黑熊四川亚种线粒体NADH的脱氢酶亚基5和亚基6基因(ND5和ND6)。[方法]根据已报道的部分熊科动物ND5和ND6基因序列的相关信息设计引物,运用PCR技术,首次从亚洲黑熊四川亚种的肌肉组织总DNA中成功克隆了ND5和ND6基因的编码序列,分析了其序列特征,并与已报道的9种熊科动物进行比较分析。[结果]该克隆片段包括ND5和ND6两个基因共2456bp,共编码781个氨基酸,与9种熊科动物的ND5和ND6具有很高的同源性;该克隆片段ND5和ND6的蛋白分子量分别为68.2621和19.0386kDa,等电点分别为9.19和4.25,与9种熊科动物的均十分接近。[结论]四川黑熊与9种熊科动物的ND5和ND6基因及其编码蛋白具有很高的相似性,在功能上具有一致性,尤其与东北黑熊在功能上具有高度一致性。
高文杰, 朱自严[7]2014年在《亚洲黑熊主要组织相容性复合体DQA及DRB基因外显子2多态性分析》文中研究指明试验旨在分析亚洲黑熊主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)DQA和DRB基因外显子2多态性。采用PCR扩增和克隆测序等方法对来自云南地区的40只亚洲黑熊DNA样本进行研究。结果发现,在40只亚洲黑熊样本中检测出了9个DQA外显子2等位基因和13个DRB外显子2等位基因,和大熊猫相比,亚洲黑熊在DQA和DRB基因外显子2位点上有较高的多态性。通过对推导出的氨基酸序列抗原结合位点的同义替换和非同义替换的比较,证明了DQA和DRB位点的平衡选择作用。
陈丽梅[8]2002年在《黑熊（Ursus thibetanus G.）电刺激采精、精液冷冻及精子体外获能的研究》文中认为本研究采用电刺激法对18头黑熊进行了23次精液采集，成功采得精液12次。黑熊每次射精量平均体积0.259±0.185ml，PH值7.0±0.0，密度13.90±8.19×10~8／ml，活力75.83±14.29％，运动状态3.75±0.27，畸形率23.09±9.54％，顶体完整率80.17±13.26％。 本研究采用叁种麻醉方案对黑熊进行麻醉：单纯盐酸氯胺酮麻醉、盐酸氯胺酮与龙朋混合麻醉、盐酸氯胺酮与鹿眠宁混合麻醉。结果表明盐酸氯胺酮与龙朋混合麻醉是一种较适合黑熊电刺激采精的麻醉方案，其用药量盐酸氯胺酮8.44mg／kg体重、龙朋1.37mg／kg体重，诱导期长为13.2min。 黑熊鲜精采用TEST、SFS、GFS叁种不同冷冻稀释液稀释进行冷冻，冷冻解冻后的精子活力和运动状态分别为：16.67％、25.00％、34.60％和3.0、3.3.、3.08；顶体完整率分别为24.67％、36.40％、35.12％，叁者之间均无显着差异(p＞0.05)，以GFS液为冷冻稀释液冷冻解冻后的复苏率最高为46.13％。采用叁种不同冷冻方法进行冷冻。方法A冷冻解冻后的活力、顶体完整率和复苏率分别为25％、36.4％和29.41％，高于方法B和方法C(方法B：15.92％、31.79％、19.21％；方法C：20％、35.33％、25％)，叁者之间均无显着差异(p＞0.05)。冷冻解冻后，精子在Ham’s F10液中活力为25％，存活时间为6.5h，高于在TCM-199中的活力和存活时间(18.10％，6.4h)。 精子体外获能液以S-TALP液为基础，选择添加不同的促获能物质，组成叁种不同的获能液；(1)S-TALP+20ug／ml肝素+5mmol／L咖啡因组；(2)S-TALP+20ug／ml肝素+5％FCS组；(3)S-TALP+45umol／L肾上腺素+70umol／L牛磺酸组。黑熊精子获能处理后与经高渗盐溶液固定的小鼠卵子作穿卵实验，叁组不同获能处理的精子附着卵子透明带的比例均为100％；穿入透明带但小于1／2ZP的，以牛磺酸与肾上腺素组最高为60％，显着高于其它两组(P＜0.05)；经肝素与咖啡因组处理的精子的穿卵率(穿入透明带＞1／2ZP+穿入卵周隙PVS％)为70.56％；经肝素与FCS组处理的精子穿卵率为52.63％，两者之间无显着差异，都大于添加肾上腺素和牛磺酸组精子的穿卵率(30％)，差异显着(p＜0.05)。
Ashfaq, Ali[9]2016年在《黑熊痕迹:34.6*131.958;粪便分析:10.8*19.7193;篇长:113371》文中认为亚洲黑熊是巴基斯坦最大的动物,然而,目前对其分布、食物选择、冲突策略、行为等仍缺乏深入了解。由于生境退化,亚洲黑熊已被IUCN列为濒危物种。本研究旨在探索亚洲黑熊的保育状态及在巴基斯坦Khyber-Pakhtunkhwa西北部可汗山谷地区的人熊冲突。结果显示,可汗山谷地区70%的居民确认当地亚洲黑熊的毁坏农作物,扑杀牲畜(n=32),攻击人类(n=15)。大部分受访者(63%)对黑熊存在负面态度,但37%的受访者持有中性态度。在这一地区,每年黑熊对玉米等农作物的损害约3.8hm2,且多数损坏发生在7~9月。通过在可汗山谷地区实地调查总计发现91处黑熊痕迹,平均越7.3次/hm2.黑熊适宜的生境一般具有50%-70%冠层郁闭度,25-35°坡度,海拔1500-3000 m。黑熊生境的植被一般为针阔混交林,对森林树木密度要求不明显。研究调查了巴基斯坦Himalaya西部可汗山谷地区亚洲黑熊食物生境和海拔分布。针对黑熊取食共参访当地居民180人,并收集不同海拔的痕迹点178个。当地村民报告黑熊主要通过森林边缘的农田利用Malkandi,Kamalband和Jaraid森林。160位受访者确认橡树(Quercus spp.),guch(Viburnum cotinifolium),白桑(Morus spp.),无花果(Ficuspalmata),pomegranate(Punicagranatum),and maize(Zea mays)等植物为可汗山谷地区黑熊的主要食物来源。本研究通过53个黑熊粪便成分分析发现21种黑熊食物来源。食性分析显示,玉米,白桑(Morus alba,)和槭树(Acer sp.)等为黑熊粪便对应的的主要食物来源,所占比例分别达到22.64%,16.98%和11.32%。通过逐月分析黑熊粪便成分,研究记录了黑熊取食转移特征。农作物占粪便体积总量的31.38%,远高于其他取食来源所占比例。亚洲黑熊被列为IUCN红色物种名录,并且认定为脆弱种(vulnerable),由于其食源中人类相关的食物具有较高的比例,对于管理该地区人熊冲突十分重要。人类活动,包括打猎,森林砍伐,基础设施建设,和毁林开荒等,是亚洲黑熊与人类冲突的主要确定因素。为更好地保育亚洲黑熊,今后的研究需要重点加强利用无线电追踪等野外调查方法研究黑熊种群特征。
朴正吉, 朴龙国, 王卓聪, 罗玉梅, 王超[10]2012年在《长白山自然保护区黑熊和棕熊种群数量动态分析》文中认为1986～2010年冬季采用路线调查方法,对吉林省长白山国家级自然保护区阔叶红松林和针叶林中的黑熊(Ursus thibetanus)及棕熊(U.arctos)的相对种群数量和幼年个体比例进行了长期调查。调查面积分别为4万和3万hm2。调查期间累计遇到黑熊65头次(2.6头/年)、棕熊46头次(1.8头/年)。各年度黑熊和棕熊的数量变动很大,总体呈下降趋势。黑熊的数量较20世纪80年代下降了93.4%,幼体所占比率从17.2%下降为0%;棕熊种群数量下降了38.8%,幼体所占比率仅为7.1%。黑熊和棕熊的种群幼体所占比例极低,说明长白山自然保护区黑熊和棕熊自然繁殖力很低,2种熊种群均处于极度濒危状态。栖息地减少和盗猎可能是导致熊类数量急剧下降的主要因素。
参考文献：
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[3]. 亚洲黑熊四川亚种(Ursus thibetanus mupinensis)线粒体ATP合酶和亚基基因克隆及序列分析[J]. 郝彦哲, 杜玉杰, 吴夏, 张田, 侯万儒. 重庆师范大学学报(自然科学版). 2008
[4]. 亚洲黑熊四川亚种Ursus thibetanus mupinensis线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅲ基因的克隆与初步分析[J]. 杜玉杰, 黎云祥, 吴夏, 陈瑜, 侯万儒. 四川大学学报(自然科学版). 2007
[5]. 五种野生动物蛔虫核糖体及线粒体DNA多态性的研究[D]. 盛中华. 吉林农业大学. 2012
[6]. 亚洲黑熊四川亚种线粒体NADH脱氢酶亚基5和亚基6基因的克隆与初步分析[J]. 杜玉杰, 侯怡铃, 侯万儒. 安徽农业科学. 2010
[7]. 亚洲黑熊主要组织相容性复合体DQA及DRB基因外显子2多态性分析[J]. 高文杰, 朱自严. 中国畜牧兽医. 2014
[8]. 黑熊（Ursus thibetanus G.）电刺激采精、精液冷冻及精子体外获能的研究[D]. 陈丽梅. 四川农业大学. 2002
[9]. 黑熊痕迹:34.6*131.958;粪便分析:10.8*19.7193;篇长:113371[D]. Ashfaq, Ali. 华中农业大学. 2016
[10]. 长白山自然保护区黑熊和棕熊种群数量动态分析[J]. 朴正吉, 朴龙国, 王卓聪, 罗玉梅, 王超. 动物学杂志. 2012