牡丹江医学院生物化学与分子生物学教研室
摘要：目的 研究长链非编码RNA NEAT2在前列腺癌中的表达。方法 以TCGA前列腺癌与癌旁组织RNA测序数据为基础，采用文献的方法，探究长链非编码RNA NEAT2在前列腺癌组织和癌旁组织中的表达，考查与年龄和种族之间的关系。结果 长链非编码RNA NEAT2在前列腺癌中表达显著高于癌旁组织，其在前列腺癌中的表达在40-60岁与60-80岁无差异，在美国白人与非裔美国人之间无显著性差异。结论 长链非编码RNA NEAT2在前列腺癌中高表达，其表达与年龄、种族无关。
前言
前列腺癌是男性多发的恶性肿瘤。近年来在我国发病率逐年增加。发病年龄也逐渐年轻化。由于早期症状不明显，临床发现多已发生远处转移。治疗手段多采用雄激素剥夺疗法，晚期可导致雄激素抵抗而无效。迫切需要寻找确切的早期诊断指标和有效的治疗靶点。
生物信息学是近年发展起来的新兴学科。用计算机手段处理生物大数据。能够在浩如烟海的生物数据中筛选出有特定要求的靶分子。成为了生物医学发展的有力武器。
我们用生物信息学的方法，利用生物大数据考查了长链非编码RNA NEAT2（也称为MALAT1）在前列腺癌中的表达。
材料与方法
1.样本
前列腺癌和癌旁样本RNA测序数据来自于TCGA数据库（http：//www.tcga.org/）。其中前列腺癌组织497例，癌旁组织52例。40-60岁222例，60-80岁273例。高加索人147例，非裔美国人6例。
2.方法
UALCAN使用TCGA 3 级RNA-seq数据和来自31种癌症类型的临床数据，这是一个交互式门户网站，用于对TCGA基因表达数据进行深入分析。该门户网站允许分析肿瘤和正常样本之间的所查询基因的相对表达，以及基于各个癌症阶段、肿瘤分级或其他临床病理特征的各种肿瘤亚组中的所查询基因的相对表达。网址是http：//ualcan.path.uab.edu.
结果
1.NEAT2在前列腺癌中的表达高于癌旁组织
为了探讨NEAT2在前列腺癌的发生和发展中的作用，我们以TCGA数据库中前列腺癌的表达谱数据为基础，采用文献提供的方法[1]，比较了NEAT2在前列腺癌和前列腺癌旁组织中的表达。结果如图1。可见NEAT2在前列腺癌中的表达显著高于癌旁组织，表明NEAT2可能在前列腺癌的发生发展过程中起一定的作用。
图1.NEAT2在前列腺癌和癌旁组织中的相对表达。与癌旁组织相比，***P<0.001。
2.NEAT2在前列腺癌中的表达与患者年龄无关
为了探讨NEAT2在前列腺癌中的表达是否与患者的年龄有关系。我们考查了不同年龄段的患者NEAT2的表达，结果如图2。由图所知，NEAT2在前列腺癌中的表达与年龄没有关系，不具有时间特异性。
图3 NEAT2在前列腺癌中的表达与患者种族的关系
讨论
前列腺癌是男性多发的恶性肿瘤，常发生于前列腺癌上皮组织。其发病隐匿，临床症状不明显。大多发现时已濒晚期，给临床治疗带来困难。迫切需要寻找能够满足早期诊断和有效治疗的分子标记物。
我们以TCGA数据库中RNA测序的3级数据和临床信息为基础，采用生物信息学的方法，比较了长链非编码NEAT2在前列腺癌和癌旁组织的表达。结果表明，NEAT2在前列腺癌中的表达显著高于癌旁组织。接着我们考查了NEAT2在不同年龄阶段前列腺癌患者中的表达，发现NEAT2在前列腺癌中的表达与患者年龄无关，没有阶段特异性。最后，我们在种族差异角度，探讨了NEAT2在美国高加索人（美国白人）和非裔美国人之间表达的差异，结果表明NEAT2在前列腺癌中的表达在两个种族之间无显著性差异。
长链非编码RNA是一类长度大于200bp，不能或很少编码蛋白质的RNA分子，以往一直认为不具备生物学功能，而最近的研究发现长链非编码RNA不但不是转录废物，而且具有重要的生理功能。可以参与机体的几乎所有过程。NEAT2是在研究肺癌转移的过程中发现的一种长链非编码RNA。在许多人类疾病中发挥重要的调控作用。NEAT2能够通过增加SREBP-1c蛋白的稳定性来促进肝脏脂肪变性和胰岛素抵抗[2]。抑制NEAT2的表达后，能够抑制卵巢癌SKOV3细胞系的肿瘤生成和介导凋亡[3]。这与我们的研究结果相符。
我们是从数据库出发得到的上述结果，其结论还需要进一步的实验验证。扩大样本数量也将有助于实验结果的完善。对NEAT2在前列腺癌中的进一步研究必将为前列腺癌的诊治提供参考。
总之，我们通过大数据分析，发现NEAT2在前列腺癌中的表达高于癌旁组织，并且其在前列腺癌中的表达与年龄无关，在美国白人和非裔美国人之间也无差异。
参考文献：
[1]Chandrashekar DS，Bashel B，Sah B，Creighton CJ，Ponce-Rodriguez I，Bvsk C，Varambally S.UALCAN：A Portal for Facilitating Tumor Subgroup Gene Expression and Survival Analyses.Neoplasia.2017；19（8）：649-658.
[2]Yan C，Chen J，Chen N.Long noncoding RNA MALAT1 promotes hepatic steatosis and insulin resistance by increasing nuclear SREBP-1c protein stability.Sci Rep.2016；6：22640.
[3]S L，X J，W L，D C，K S，J Y.Inhibition of the long non-coding RNA MALAT1 suppresses tumorigenicity and induces apoptosis in the human ovarian cancer SKOV3 cell line.Oncology letters.2016；11（6）：3686-3692.
基金项目：黑龙江省大学生创新创业训练计划；项目编号：201810229016
论文作者:刘雨天,黄欣,张忠园,冷雨,季琳（通讯作者）,崔荣
论文发表刊物:《健康世期界》2019年15期
论文发表时间:2019/12/3
标签：前列腺癌论文; 组织论文; 年龄论文; 高于论文; 方法论文; 数据论文; 患者论文; 《健康世期界》2019年15期论文;