PCR-反向点杂交法结核分枝杆菌利福平耐药相关基因rpoB突变论文_黄丽静,陈焯彬,李崇建

(广西钦州市第一人民医院 广西钦州535000)

【摘要】目的 探究对结核分枝杆菌利福平耐药相关基因rpoB突变以PCR-反向点杂交法检测的效果。方法 设计结核分歧杆菌rpoB基因引物,采用PCR-反向点杂交法对40例结核杆菌临床菌株耐药性进行检测,对照由DNA测序法检测的标准结核分歧杆菌(H37Rv)rpoB基因,确定rpoB基因的变异情况,对PCR-反向点杂交法的灵敏度和准确性作出评价。结果 40株临床菌株中有11株利福平敏感株的基因序列与对照的H37Rv相同,剩下的29株耐药株中检测到变异基因27株,其特异性为100%,阳性率为93.1%。结论 rpoB基因本身高度保守,但由于rpoB 基因突变导致结核分枝杆菌对利福平耐药。本研究使用PCR-反向点杂交法针对rpoB基因高突变区设计引物,此方法快速、简便、准确, 能有效监测临床标本中结核分枝杆菌, 对临床早期诊治结核病有极大帮助。

【关键词】PCR-反向点杂交法;rpoB 基因;利福平;结核分歧杆菌

结核病是一种由分歧杆菌导致的常见可致命传染病,它不仅能感染并破坏人体对淋巴系统,还能对人体神经系统、泌尿系统、循环系统、皮肤、骨骼、关节等其他部位造成伤害,表现为发热、盗汗、呼吸障碍、咳嗽、咯血、胸痛等,因此,必须及时对结核病进行诊治,防止其对机体造成更大伤害。利福平(RFP)是临床上治疗结合病的常用药物,但由于结核杆菌常常对其具有耐药性且各地区耐药情况不同,普通的结核杆菌培养耗时较长、过程繁琐,已经不足以满足及时诊治的需求。PCR-反向点杂交法是一种能直接快速检测结核杆菌基因突变情况的技术,其特异性强,灵敏度高,适合临床快速检测。本研究中,通过用PCR-反向点杂交法对40株结核杆菌耐RFP分离株rpoB基因突变情况,对照结核杆菌标准株,了解rpoB基因突变与结核杆菌耐药性关系,并对PCR-反向点杂交法效果进行分析,现报道如下:

1 资料和方法

1.1来源及特性 选取40株于2013年1月-2015年1月在我院治疗的活动性肺结核患者痰液标本分离的结核杆菌菌株,标准菌株同样来源于我院病原生物实验室,根据国家结核病诊断及细菌学检验标准[1],对结核杆菌进行培养、鉴定及药敏试验。其中对利福平敏感菌株11株,结核杆菌耐药菌株29株,单耐药菌株18株,含量>50μg/ml,多耐药菌株11株,含量50~250μg/ml。

1.2方法 ①模板制备及PCR:40株实验菌株及标准菌株均从培养平板上挑取菌落5个,用5ml生理盐水混匀沸水浴10min,6000r/min离心5min,上清液为PCR模板。PCR扩增rpoB基因引物,范围包括RFP耐药决定区,上游引物DNA序列:5'-AAGGAGTTCTTCGGCACCAG-3',下游引物:5'-GGTTTCGA TCGGGCACATCC-3'。引物250mmol/L、dNTP2.5mol/升,模板2μL、10×PCR缓冲液。条件:先94 ℃ 3min预变性,再 94℃ 30s、52 ℃ 30s、72 ℃30s,循环35次,最后72 ℃7min延伸。检测扩增产物:溴乙锭预染的2%琼脂糖凝胶电泳。②反向斑点杂交(RDB):将膜条与PCR产物加入杂交试剂盒杂交液(2×SSC)中,水浴加热10min,42℃杂交4h,转移膜条至0.5×SSC液中,42℃轻摇并洗涤15min,避光显色20min,观察结果。若单链和H37Rv标准株单链位置不同,称运动变位,判定突变。

1.4 统计学分析 采用SPSS15.0软件进行数据处理和统计分析,计数资料用百分比(%)表示。

2 结果

若扩增成功(40株临床菌株均获得189bp阳性扩增产物),则此引物对结核杆菌有特异性。对照标准菌株H37Rv,对比临床菌株RFP敏感株标准图谱,与对照相同的有11株,无rpoB 基因突变,其他29株RFP耐药株有27株SSCP带谱与对照不同,则有rpoB 基因的突变,对比药敏试验结果,其阳性检出率为93.1%。见表1

3 讨论

结核病是临床上常见传染病之一,严重的甚至导致死亡,利福平是治疗结核病的关键药物,它可以能结合RNA聚合酶β亚基,从而抑制转录起到杀菌效果,有研究表明,虽然结核杆菌RFP耐药性可能由多种原因导致,但RNA聚合酶β亚基通过rpoB基因编码,rpoB基因的耐药区发生突变是其产生耐药性的主要原因,因此如何快速、有效的检测出rpoB基因的突变是判断结核杆菌RFP耐药性的关键[2]。

传统RFP利福平耐药性检测方法一般通过培养的方法进行药物敏感实验,这个过程大约需要6~12周,极为耗时,容易贻误患者治疗,为满足现代短程化疗需要,通过PCR-反向点杂交法可以快速检测rpoB基因RNA聚合酶β亚基507~533位氨基酸耐药区点突变,这个过程大约只需要1~2d,具有特异性高、快速、简便等优点,并且与DNA测序检测结果的符合率高,能为医师用药提供有效指导作用,使患者得到及时治疗,减轻病人负担,符合临床上对结核杆菌快速检测的需求。本研究中发现,采用PCR-反向点杂交法检测的40例临床菌株,耐药菌株29例,其中又27株检测出阳性反应,阳性检出率高达93.1%,可见对结核分枝杆菌RFP耐药采用PCR-反向点杂交法具有操作简便、时间较短、检出率高等优点,与相关文献报告相一致[3]。

综上所述,采用PCR-反向点杂交法检测结核分枝杆菌利福平耐药性,快速有效,有临床推广价值。

参考文献

[1] 褚美芬,严杰,钟雅文等.快速检测结核分枝杆菌异烟肼和利福平耐药相关基因mPCR-SSCP建立及应用[J].中华微生物学和免疫学杂志,2012,32(7):655-660.

[2] 刘家云,徐修礼,孙惠平等.耐药结核分枝杆菌基因突变分析[J].中华检验医学杂志,2010,33(7):594-598.

[3] 邱媛,陶峰,孙爱华等.PCR-SSCP检测结核分枝杆菌利福平耐药相关基因rpoB突变[J].中国微生态学杂志,2013,25(5):571-573,576.

论文作者:黄丽静,陈焯彬,李崇建

论文发表刊物:《医师在线》2016年1月第2期

论文发表时间:2016/5/24

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